git Игнорировать изменения прав доступа

git config core.fileMode false

В конфиге:

core.fileMode
 If false, the executable bit differences between the index and the
 working copy are ignored; useful on broken filesystems like FAT.
 See git-update-index(1). True by default.


-c для установки в одной команде:

git -c core.fileMode=false diff

--global Установит поведение по умолчанию для текущего юзера:

git config --global core.fileMode false


core.fileMode Охватывает только бит исполнения.